考馬斯亮藍（Coomassie brilliant blue）是兩種相似三苯甲烷染料的總稱，有(yǒu)G250和R250兩種，結構上前者比後者多(duō)了2個甲基，命名(míng)上“G”為(wèi)Green 的縮寫，因G250的藍色染料泛淺綠色；命名(míng)上“R”為(wèi)Red的縮寫，因R250的藍色染料呈微紅色調；“250”表示考馬斯亮藍的純度。生化實驗中(zhōng)常将考馬斯亮藍用(yòng)于蛋白定量和蛋白電(diàn)泳中(zhōng)蛋白染色。工(gōng)作(zuò)原理(lǐ)是：通過與蛋白質(zhì)内的氨基和羧基基團間的靜電(diàn)結合作(zuò)用(yòng)以及範德(dé)華力，考馬斯亮藍與蛋白質(zhì)形成強但非共價鍵連接的複合物(wù)。蛋白-染料複合物(wù)的形成穩定染料攜帶的負電(diàn)荷陰離子（如磺酸基），從而産(chǎn)生在膜上或者膠上肉眼可(kě)見的藍色。

考馬斯亮藍R250（Coomassie brilliant blue R250）更多(duō)用(yòng)于電(diàn)泳蛋白的染色，染色靈敏度比氨基黑高5倍，可(kě)達0.1 µg蛋白。但是染色背景比較深，需要褪色後才能(néng)進行蛋白條帶的觀察。考馬斯亮藍G250對蛋白膠染色的靈敏度相對較差，最低檢測到0.5 µg蛋白。但是因其在三氯乙酸中(zhōng)不溶而以膠體(tǐ)形式存在，選擇性的和蛋白質(zhì)結合形成複合物(wù)，染色迅速，着色深的蛋白質(zhì)條帶數秒(miǎo)内可(kě)以顯現出來，約45 min後着色最深。而且染色背景低，不需要脫色即可(kě)進行蛋白條帶的觀察。因此，非常适合對電(diàn)泳凝膠蛋白的快速定性分(fēn)析。

考馬斯亮藍G250較多(duō)的用(yòng)于溶液體(tǐ)系中(zhōng)蛋白的定量分(fēn)析，即Bradford蛋白結合檢測法（Bradford protein-binding assay），此方法利用(yòng)的就是G250與蛋白質(zhì)結合的特性，Bradford試劑（也就是酸化的G250溶液）為(wèi)陽離子，主要為(wèi)雙質(zhì)子化，溶液為(wèi)紅色，其最大吸收波長(cháng)（Amax）為(wèi)470 nm。當與蛋白穩定結合後，G250以陽離子，非質(zhì)子化的形式存在，溶液變為(wèi)藍色，最大吸收波長(cháng)遷移到595 nm。藍色陽離子形式染料的量與樣本中(zhōng)蛋白的量成正比，因此通過直接測定595 nm的吸光度來反映蛋白量。此法的優點在于G250與蛋白質(zhì)結合所需的時間較短（約2 min左右），且結合的G250-蛋白質(zhì)複合物(wù)室溫下約1 h内保持穩定。反應靈敏度高，是一種非常常用(yòng)的微量蛋白快速定量方法。